異國短毛貓是波斯貓的一個重要分支，繼承了波斯貓可愛的容貌和溫柔的性格同時，也繼承了波斯貓由于過度純化而產生的各種遺傳疾病。為了能夠買到健康的貓貓。了解，詢問買家，確認買家也了解這些遺傳疾病非常重要。
致死呼吸困難
扁平的臉和鼻子。這種面部特征讓波斯系貓容易產生呼吸困難，皮膚，眼睛疾病以及難產等各種問題。扁臉寵物解剖學上的異常會造成呼吸短促以及有異聲?；蔚臏I管也會造成淚管堵塞，一種使眼淚不斷益處流到臉上的癥狀，這種癥狀在波斯系貓中很常見一般沒有其他問題。但也有可能是更嚴重的情況造成的副作用。比如眼簾內翻，造成眼睫毛反復刷角膜會造成流淚，痛苦，感染，以及角膜損傷。類似的上眼簾或者眼角內睫癥也會造成對角膜的磨損，并導致流淚。難產，也在波斯系貓中非常常見。一個1973只波斯貓的調查指出波斯貓的難產率（22.1%）比普通貓（16.1%）高，而死亡率更高達29.2%。2010年度一份獸醫報告指出，難產是由于扁臉特征而造成。
由于BBC節目對于純種狗的報道，貓咪繁殖人士也受到了獸醫和動物保護/福利組織的壓力.由于波斯貓是貓中最受健康問題困擾的品種，動物保護組織提議改變波斯貓的培育標準以防止過度特征化波斯貓的扁臉特征，并禁止繁育超過一定標準的貓。GCCF限制了貓鼻子的高度（不得高于眼角），TICA以及FIFE更限制了貓鼻孔必須打開。其中FIFE更申明，合格的波斯系貓鼻子必須包含“自由并便捷的空氣通道”。德國動物福利法案也同樣禁止繁育鼻尖高于下眼簾的扁臉貓。
多囊性腎病
（PKD會造成成貓腎衰竭)在波斯系中發病率達到36-49%。晶體不斷的生成并覆蓋腎漸漸替代正常腎組織并造成腎腫大。平均大約7歲（3-10歲）貓會產生腎衰竭癥狀有大量飲水排尿，以及食欲降低，消瘦，以及抑郁。這種疾病是常染色體顯性，超聲波或者DNA檢測可以將得病個體從繁殖群體內排除以減少甚至與消滅在某些血統中這種疾病的發病率。trust注：所以詢問并檢查父母雙方是否是族譜全為PKD，HCM陰性非常重要。
心室肥大癥
心室肥大癥是一種所有貓中常見心臟病。它在Maine Coon，美國短毛貓（trust注：異國短毛貓有波斯及美國短毛貓血統），以及可能波斯貓中遺傳。疾病會造成左心室肥大，并最后造成猝死。一般于男性或者老年個體中發病。波斯貓的發病率為6.5%。與PKD能在早期發現不同，心臟測試要不間斷的進行才能從繁育群體中除去帶病個體。
基于純種貓由于過度純化（近親繁殖）遺傳疾病的普遍性，這也是重要的一個原因為什么我們建議所有非繁殖寵物絕育。因為非繁殖寵物一般不會去進行各種遺傳疾病檢查，如果萬一產生后代，可能再次污染好不容易建立的無遺傳病繁殖群體。
其他可能出現的遺傳疾?。?br />
進行性視網膜萎縮，隱性遺傳疾病。有人相信只有巧克力以及喜瑪拉雅的線會發病，但是沒有證據表明此疾病和皮毛顏色相關。
底層細胞癌是一種頭部，背部，以及胸部常見皮膚癌。常為良性，惡性常見于波斯貓系。
藍色煙熏波斯系常有多系統并發隱性遺傳病。白貓包括純白波斯貓（藍眼），常為耳聾。
波斯對打蟲藥也更為敏感。
髖關節發育不良。
咬合錯位（牙齒錯位）trust注：多數貓協會要求咬合沒有問題。即使沒有咬合錯位波斯系也有顯而易見的進食困難，因為扁平的小肥臉。。。所以波斯貓甚至有特殊的碗。
